MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium intracellulare MOTT-02 chromosome

Total Repeats: 146102

< Previous12...281282283284285286287288289290291292293Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
146001	NC_016947	GGC	2	6	5405630	5405635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379757157
146002	NC_016947	GGCT	2	8	5405639	5405646	0 %	25 %	50 %	25 %	379757157
146003	NC_016947	TCT	2	6	5405664	5405669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146004	NC_016947	TGCGG	2	10	5405712	5405721	0 %	20 %	60 %	20 %	379757158
146005	NC_016947	G	6	6	5405755	5405760	0 %	0 %	100 %	0 %	379757158
146006	NC_016947	CAC	2	6	5405785	5405790	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379757158
146007	NC_016947	GCG	2	6	5405801	5405806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379757158
146008	NC_016947	TGC	2	6	5405812	5405817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379757158
146009	NC_016947	CGC	2	6	5405929	5405934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379757158
146010	NC_016947	CCG	2	6	5405949	5405954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379757158
146011	NC_016947	CG	3	6	5405995	5406000	0 %	0 %	50 %	50 %	379757158
146012	NC_016947	ACC	2	6	5406008	5406013	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379757158
146013	NC_016947	TCG	2	6	5406032	5406037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379757158
146014	NC_016947	GCCC	2	8	5406133	5406140	0 %	0 %	25 %	75 %	379757158
146015	NC_016947	GAG	2	6	5406175	5406180	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379757158
146016	NC_016947	CAG	2	6	5406244	5406249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379757158
146017	NC_016947	CCCGCA	2	12	5406263	5406274	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	379757158
146018	NC_016947	GCG	2	6	5406341	5406346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379757158
146019	NC_016947	CG	3	6	5406367	5406372	0 %	0 %	50 %	50 %	379757158
146020	NC_016947	GGCCG	2	10	5406388	5406397	0 %	0 %	60 %	40 %	379757158
146021	NC_016947	GCA	2	6	5406503	5406508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379757159
146022	NC_016947	CTCGCT	2	12	5406537	5406548	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	379757159
146023	NC_016947	CCG	2	6	5406563	5406568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379757159
146024	NC_016947	CGT	2	6	5406575	5406580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379757159
146025	NC_016947	CGC	2	6	5406646	5406651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379757159
146026	NC_016947	GCC	2	6	5406670	5406675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379757159
146027	NC_016947	CGCCGG	2	12	5406685	5406696	0 %	0 %	50 %	50 %	379757159
146028	NC_016947	TCT	2	6	5406740	5406745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379757159
146029	NC_016947	CGC	3	9	5406791	5406799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379757159
146030	NC_016947	GTC	2	6	5406819	5406824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379757159
146031	NC_016947	GCC	2	6	5406825	5406830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379757159
146032	NC_016947	CAC	2	6	5406840	5406845	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379757159
146033	NC_016947	CAA	2	6	5406900	5406905	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379757159
146034	NC_016947	CTC	2	6	5406906	5406911	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379757159
146035	NC_016947	CTC	2	6	5406951	5406956	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379757159
146036	NC_016947	GTC	2	6	5406960	5406965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379757159
146037	NC_016947	CTC	2	6	5406969	5406974	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379757159
146038	NC_016947	GCC	2	6	5407000	5407005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379757159
146039	NC_016947	GGT	2	6	5407041	5407046	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379757159
146040	NC_016947	TC	3	6	5407067	5407072	0 %	50 %	0 %	50 %	379757159
146041	NC_016947	GCC	2	6	5407102	5407107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
146042	NC_016947	CCG	2	6	5407135	5407140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
146043	NC_016947	GCGTTT	2	12	5407146	5407157	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	379757160
146044	NC_016947	CG	3	6	5407165	5407170	0 %	0 %	50 %	50 %	379757160
146045	NC_016947	CTCCGC	2	12	5407239	5407250	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	379757160
146046	NC_016947	CCCG	2	8	5407296	5407303	0 %	0 %	25 %	75 %	379757160
146047	NC_016947	GCC	2	6	5407309	5407314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379757160
146048	NC_016947	GCTTCG	2	12	5407325	5407336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379757160
146049	NC_016947	GCC	2	6	5407357	5407362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379757160
146050	NC_016947	GC	3	6	5407365	5407370	0 %	0 %	50 %	50 %	379757160
146051	NC_016947	CTT	2	6	5407383	5407388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379757160
146052	NC_016947	TCT	2	6	5407396	5407401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379757160
146053	NC_016947	ATC	2	6	5407408	5407413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379757160
146054	NC_016947	TGC	3	9	5407426	5407434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379757160
146055	NC_016947	TGT	2	6	5407448	5407453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379757160
146056	NC_016947	GAT	2	6	5407470	5407475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379757160
146057	NC_016947	GGAA	2	8	5407483	5407490	50 %	0 %	50 %	0 %	379757160
146058	NC_016947	ACC	2	6	5407501	5407506	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379757160
146059	NC_016947	TCA	2	6	5407541	5407546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379757160
146060	NC_016947	GCC	3	9	5407564	5407572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379757160
146061	NC_016947	ATC	2	6	5407633	5407638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379757160
146062	NC_016947	CGGC	3	12	5407661	5407672	0 %	0 %	50 %	50 %	379757160
146063	NC_016947	CGTC	2	8	5407763	5407770	0 %	25 %	25 %	50 %	379757160
146064	NC_016947	GGT	2	6	5407839	5407844	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379757160
146065	NC_016947	GGCA	2	8	5407906	5407913	25 %	0 %	50 %	25 %	379757160
146066	NC_016947	CTT	2	6	5407992	5407997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379757160
146067	NC_016947	CG	3	6	5408079	5408084	0 %	0 %	50 %	50 %	379757160
146068	NC_016947	GAA	2	6	5408124	5408129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379757160
146069	NC_016947	AAC	2	6	5408155	5408160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379757160
146070	NC_016947	GTA	2	6	5408193	5408198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379757160
146071	NC_016947	ACTC	2	8	5408235	5408242	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
146072	NC_016947	ACC	2	6	5408261	5408266	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
146073	NC_016947	GCG	2	6	5408466	5408471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379757161
146074	NC_016947	AATC	2	8	5408503	5408510	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
146075	NC_016947	CACC	2	8	5408547	5408554	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
146076	NC_016947	CCG	2	6	5408607	5408612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379757162
146077	NC_016947	CGA	2	6	5408634	5408639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379757162
146078	NC_016947	CGG	2	6	5408728	5408733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379757162
146079	NC_016947	CCG	2	6	5408753	5408758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379757162
146080	NC_016947	CGTCG	2	10	5408799	5408808	0 %	20 %	40 %	40 %	379757162
146081	NC_016947	CCG	2	6	5408809	5408814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379757162
146082	NC_016947	ACG	2	6	5408836	5408841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379757162
146083	NC_016947	TGCG	2	8	5408912	5408919	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
146084	NC_016947	CCG	2	6	5408927	5408932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
146085	NC_016947	GC	3	6	5408961	5408966	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
146086	NC_016947	GGC	2	6	5408967	5408972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
146087	NC_016947	GCG	2	6	5408977	5408982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
146088	NC_016947	CG	3	6	5408998	5409003	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
146089	NC_016947	ACG	2	6	5409092	5409097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146090	NC_016947	GTT	2	6	5409106	5409111	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146091	NC_016947	GGT	2	6	5409166	5409171	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
146092	NC_016947	TGC	3	9	5409174	5409182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146093	NC_016947	GTG	2	6	5409202	5409207	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
146094	NC_016947	CGC	3	9	5409294	5409302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
146095	NC_016947	TTCCG	2	10	5409322	5409331	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
146096	NC_016947	CTCGG	2	10	5409338	5409347	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
146097	NC_016947	AGC	2	6	5409473	5409478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146098	NC_016947	TGG	2	6	5409499	5409504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
146099	NC_016947	TTC	2	6	5409538	5409543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146100	NC_016947	GAC	2	6	5409588	5409593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146101	NC_016947	TCG	2	6	5409635	5409640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146102	NC_016947	CGT	2	6	5409691	5409696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

< Previous12...281282283284285286287288289290291292293Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.